Esta amenaza afecta al objeto de conservación Guanaco. Al interior de la unidad se han cometido hechos de captura o caza ilegal de individuos de guanaco con fines comerciales, de consumo u otros.
Esta es una práctica que forma parte de las tradiciones regionales, existen hechos recientes en el Parque Nacional Llanos de Challe, sin embargo, se desconoce la ocurrencia efectiva en el territorio del parque y en el tiempo.
Según antecedentes entregados por los guardaparques de la unidad, se han registrado casos en sector del Farellón Costero (Lomitas) (2003), Planta Esmeralda (3 individuos degollados y con sus extremidades) (2001) y Las Collajas donde se encontró restos de rumen (2012), otro caso muy particular de cacería de zorros, ocurrió en la decada del ’60.
La amenaza tiene relación directa a la existencia de huellas y caminos vehiculares al interior de la unidad.